METAGENOMIK FUNGSIONAL: KERAGAMAN GEN AMILASE DARI Axis kuhlii DAN RANCANGAN SELEKSI PROTEIN REKOMBINANNYA

Abstract

Metagenomik fungsional terbukti efektif dalam menemukan enzim baru langsung dari sampel lingkungan tanpa bergantung pada kultur mikroba. Penelitian sebelumnya berhasil mengidentifikasi delapan enzim selulase aktif (lima endoglukanase dan tiga ß-glukosidase) dari feses Axis kuhlii menggunakan workflow cepat berbasis multiplex PCR, Rolling Circle Amplification (RCA), dan ekspresi langsung pada Komagataella phaffii. Penelitian ini melanjutkan pendekatan tersebut dengan fokus pada skrining amilase dari metagenom feses A. kuhlii. Tahapan meliputi multiplex PCR, rekombinasi ke vektor pPICZaA dengan Gibson Assembly, RCA, transformasi ke K. phaffii, serta analisis karakter enzim. Hasil yang diperoleh dari penelitian selanjutnya menunjukkan adanya keragaman gen amilase pada sampel feses A. kuhlii serta rancangan plasmid rekombinan dengan insert berupa amilase terpilih. Luaran ini diharapkan dapat memberikan langkah awal untuk menghasilkan kandidat amilase fungsional baru yang berpotensi sebagai biokatalis industri sekaligus mendukung konservasi keanekaragaman hayati.